安丘经济开发区共设置5个内设机构：党政办公室、投资促进局、经贸发展局、建设管理局和财政局。无下设事业机构。 

　　1.党政办公室。（负责人：闫文玲；联系电话：0536-4736566）主要负责对外联络、党建、文稿起草、政务公开、政务信息公开、公务接待、会务安排、安全保卫、后勤服务等管理工作；负责开发区雇员、区内企业和社会管理机构的考核督查工作；负责规范性文件、合同、协议的审查备案工作；负责重大事项的合法性审查把关。 

　　2.投资促进局。（负责人：李天河）主要负责双招双引工作，统筹项目引进、项目承接、动能转换、产业培育等关联性工作；负责利用外资、外贸进出口、对外经济合作、中外合作园区建设及外商投诉处理等工作；负责签约落户项目的规划、国土、备案、环评、建设等手续的协调办理工作；做好开发区产业策划和招商政策研究制定、宣传、落实等工作；负责辖区内综合性安全生产监督管理和环境监察管理。 

　　3.经贸发展局。（负责人：周媛）主要负责研究制定开发区中长期经济社会发展规划、编制年度经济社会发展计划、分解经济指标；负责编制和实施产业发展规划、起草和实施产业发展政策；负责工业经济运行监控、预测、分析及相关协调工作；负责商贸、物流和服务业发展规划、政策研究落实、市场体系建设、考核工作；负责推进企业“两化”融合、节能降耗工作；负责组织实施各类定期统计、普查、调查和统计培训等工作；负责企业转型升级、产学研合作、高新企业孵化、信用体系建设、金融风险防范、知识产权申报管理、人才管理、创新创业等工作。 

　　4.建设管理局。（负责人：刘勇）负责协调区内项目、基础设施和公共服务设施的建设和管理工作。 

　　5.财政局。（负责人：王淑宝）主要承担预决算编制、财政资金、财经纪律执行等职能；做好项目单位优惠政策兑现落实和开发区建设用地资金收缴工作；负责开发区各项基金管理工作；负责内部审计工作。